Corso di Laurea Magistrale in Scienze animali - SAN

Tecniche di diagnosi e analisi molecolari 2

Anno accademico 2011/2012

• Tecniche di laboratorio integrate (AGR0134)

Sommario insegnamento

• Obiettivi formativi
• Risultati dell'apprendimento attesi
• Programma
• Testi consigliati e bibliografia
• Strumenti didattici

Obiettivi formativi

Acquisire le basi teoriche e pratiche di alcune tra le principali tecniche molecolari per la diagnosi in campo agrario. Possedere una solida preparazione di base indispensabile per proseguire gli studi universitari.

Risultati dell'apprendimento attesi

Il corso si propone di fornire conoscenze teoriche e pratiche sulle principali tecniche di biologia molecolare applicate al campo agrario.

Programma

Introduzione

Applicazioni: funghi e batteri fitopatogeni, patogeni umani, OGM, resistenza a fungicidi…

Tecniche per la diagnosi di funghi e batteri fitopatogeni

Isolamento di funghi

Preparazione di substrati

Identificazione al microscopio di funghi fitopatogeni

Estrazione di DNA da funghi (kit, chimica, KingFisher, QiaCube)

PCR classica

Elettroforesi su gel di agarosio

RAPD e AFLP

BIOINFORMATICA: Disegno di primer con primer 3, Blast, Allineamento di sequenze

Costruzione di alberi filogenetici

Analisi di sequenze (DNA/cDNA, presenza di introni, SNP, aplotipi. INDEL)

Analisi di proteine

Estrazione di RNA

Retrotrascrizione di RNA a cDNA

Espressione genica

Real time PCR

Multiplex real time PCR con 4 canali

Individuazione di SNPs: high resolution melting

Studio dei meccanismi coinvolti nella lotta biologica: in vitro, in vivo

Clonaggio di geni (glucanasi, chitinasi, proteasi)

Simulazione di clonaggio di geni in silico

Sequenziamento di genomi (next-gen sequencing)

Sviluppo di nanosensori

Sviluppo di microarray

Sviluppo di lab on a chip

Il docente fornirà materiale didattico inerente gli argomenti trattati a lezione e durante le esercitazioni pratiche.

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