- Oggetto:
- Oggetto:
Laboratorio di tecniche di analisi genetica (Anno Accademico 2015/2016)
- Oggetto:
GENETIC ANALYSIS TECHNIQUES
- Oggetto:
Anno accademico 2015/2016
- Codice dell'attività didattica
- AGR0165
- Docente
- Prof. Sergio LANTERI (Affidamento interno)
- Corso di studi
- [f001-c717] L - Scienze e tecnologie agrarie
- Anno
- 3° anno
- Tipologia
- F - Altre attività
- Crediti/Valenza
- 4
- SSD dell'attività didattica
- AGR/07 - genetica agraria
- Modalità di erogazione
- Tradizionale
- Lingua di insegnamento
- Italiano
- Modalità di frequenza
- Obbligatoria
- Tipologia d'esame
- Quiz
- Prerequisiti
- Aver sostenuto l'esame di Genetica e miglioramento genetico
- Oggetto:
Sommario insegnamento
- Oggetto:
Obiettivi formativi
Il laboratorio ha l'obiettivo di far acquisire conoscenze e competenze sulle applicazioni delle tecniche di analisi del DNA (marcatori molecolari), con particolare riferimento al campo vegetale. I marcatori molecolari rappresentano uno strumento efficace ed affidabile, oggi ampiamente utilizzato per analisi genetiche quali : fingerprinting varietale, tracciabilità lungo la filiera alimentare, valutazione della purezza di lotti di seme, identificazione di un componente di un alimento ecc.
The lab activities will provide knowledge and skills on the applications of DNA analyses (molecular markers), with particular reference to the plants. Molecular markers are a powerful and reliable tool which is nowadays widely applied for genetic analyzes such: varietal fingerprinting, traceability along the food chain, evaluation of the purity of seed lots, identification of a food component etc.
- Oggetto:
Risultati dell'apprendimento attesi
Lo studente dovrà essere in grado di realizzare in modo autonomo: (i) l’estrazione del DNA da un tessuto vegetale o da una matrice alimentare; (ii) la quantificazione del DNA estratto mediante fluorimetria e spettrofotometria; (iii) la tecnica PCR e l’analisi dei risultati ottenuti mediante tecnica elettroforetica. Inoltre, lo studente posto di fronte ad un problema, dovrà essere in grado di identificare e applicare la più appropriata tecnica di analisi molecolare per la sua soluzione
The students will be able to independently perform (i) the extraction of DNA from a plant tissue or food matrix; (ii) the quantification of the extracted DNA by fluorimetry and spectrophotometry; (iii) the PCR technique and the analysis of the obtained result by electrophoretic technique and Licor4200 sequencer. Furthermore, students will be able to identify and apply the most suitable molecular technique for problem solving .
- Oggetto:
Modalità di insegnamento
- Oggetto:
Modalità di verifica dell'apprendimento
All'inizio di ogni attività di laboratorio il docente stimolerà la discussione con gli studenti sugli argomenti trattati nelle attività precedenti con il fine di chiarire eventuali dubbi e verificare lo stato di apprendimento della classe.
At the beginning of each lab activity the teacher will stimulate discussion with students on the topics covered in previous activities, in order to clarify doubts and verify their learning status.
- Oggetto:
Programma
Area della conoscenza : Tecnica
- Inquadramento del problema scientifico
- Attività teoriche in aula: principi su cui si basano le tecniche di estrazione del DNA; PCR e sue applicazioni; marcatori genetici (morfologici, biochimici e molecolari con approfondimento sui marcatori microsatellite e SNP. Campi di applicazione delle tecniche di analisi del DNA.
- Attività sperimentali in aula informatica:database, formati di sequenza, identificazione di marcatori microsatelliti, disegno di primer.
- Attività sperimentali in laboratorio: estrazione del DNA, amplificazione PCR di loci SSR, analisi del polimorfismo mediante elettroforesi anche su sequenziatore Licor4200.
Area of knowledge: Technology
- Approach to the scientific problem.
- Teaching activity: DNA extraction principles; PCR and its application; genetic markers (morphological, biochemicals, molecular) with special reference to SSR and SNP markers. Fields of application of molecular marker techniques.
- Bioinformatics experimental activities: databases, sequence formats, identification of microsatellite markers, primer design.
- Practical activity in lab: DNA extraction, PCR amplification of SSR loci, detection and analysis of detected polymorphisms by electrophoresis also in Licor4200 sequencer.
Il laboratorio prevede l’applicazione di tecniche di analisi molecolare del DNA per la soluzione di problemi di natura applicativa, scientifica e legale
The laboratory provides for the application of DNA analysis molecular techniques for the solution of practical, scientific and legal problems
Testi consigliati e bibliografia
- Oggetto:
BARCACCIA G., FALCINELLI M. Genetica e genomica, capitolo 17, Volume III, Liguori Editore.
BARCACCIA G., FALCINELLI M. Genetica e genomica, capitolo 17, Volume III, Liguori Editore.
- Oggetto:
Note
Pre-requisiti: per poter seguire il laboratorio è propedeutico l'esame di "Genetica e miglioramento genetico" per gli studenti del corso di laurea in Scienze e tecnologie agrarie, Scienze agrarie e Scienze zootecniche.
Pre-requisites: to follow this laboratory is propaedeutic the exam of " Genetics and plant breeding’ for students of Agricultural Science and Technology, Agricultural Science and Animal Science courses.
- Oggetto:
