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Laboratorio di tecniche di analisi genetica (Anno Accademico 2016/2017)

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Techniques of genetic analyses

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Anno accademico 2016/2017

Codice dell'attività didattica
AGR0165
Docente
Prof. Sergio LANTERI (Affidamento interno)
Corso di studi
[f001-c717] L - Scienze e tecnologie agrarie
Anno
3° anno
Tipologia
F - Altre attività
Crediti/Valenza
4
SSD dell'attività didattica
AGR/07 - genetica agraria
Modalità di erogazione
Tradizionale
Lingua di insegnamento
Italiano
Modalità di frequenza
Obbligatoria
Tipologia d'esame
Orale
Prerequisiti
esame di Genetica e miglioramento genetico
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Sommario insegnamento

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Obiettivi formativi

Il laboratorio ha come principale obiettivo di far acquisire competenze pratiche relative alle tecniche di estrazione del DNA da tessuti vegetali, quantificazione del DNA estratto, amplificazione PCR di marcatori microsatellite,  tecnica elettroforetica ed analisi dei risultati. Inoltre, verranno forniti esempi dell'applicazione delle tecniche di analisi molecolare del DNA per: (i) il fingerprinting varietale, (ii) la tracciabilità  di un prodotto lungo la filiera alimentare, (iii) la valutazione della purezza di lotti di seme, (iv) la costruzione di mappe genetiche in specie agrarie, (v) studi di genetica di popolazione. 

 

The lab activities will provide practical skills on DNA extraction from plant tissues,  quantification of the extracted DNA,  PCR amplification of microsatellite markers, electrophoresis and analysis of the results.  Furthermore,  examples of  the  applications of  molecular markers for (i)  varietal  fingerprinting, (ii)  traceability of a product along the food chain, (iii) assessment of the purity of seed lots, (iv) construction of gnetic maps, (v) population genetics studies will be provided and discussed. 

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Risultati dell'apprendimento attesi

Lo studente dovrà essere in grado di realizzare in modo autonomo: (i)  l’estrazione del DNA da un tessuto vegetale ; (ii)  la  quantificazione del DNA estratto  mediante analisi su gel di agarosio, tecnica  fluorimetrica e spettrofotometrica; (iii) l' applicazione della tecnica PCR  per lo studio di loci microsatellite, (iv)  l’analisi dei risultati  mediante tecnica elettroforetica. Inoltre, lo studente dovrà  essere a conoscenza dei principali campi di applicazione delle tecniche di analisi  molecolare del DNA e di risolvere semplici problemi ad essi riferiti.

 

 

The students will be able to independently perform  (i) the extraction of DNA from a plant tissues ; (ii) the quantification of the extracted DNA by means of gel electrophoresis,   fluorimetry and spectrophotometry; (iii) the application of the  PCR technique for the analysis of microsatellite loci ; (iv) the analysis of the results following electrophoresis. Furthermore, the students have to be aware of the field of application of molecular markers and be able to solve problems related to them.

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Modalità di insegnamento

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Modalità di verifica dell'apprendimento

All'inizio di ogni attività di laboratorio il docente stimolerà la discussione su argomenti trattati in precedenza al fine di chiarire eventuali dubbi e verificare lo stato di apprendimento degli studenti

 

At the beginning of each lab activity the professor  will stimulate  the discussion on the topics covered in previous activities, with the goal to    verify the learning status od the students.

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Programma

Area della conoscenza : Tecnica

- Attività teoriche in aula: principi su cui si basano le tecniche di estrazione del DNA;  PCR e sue applicazioni;  marcatori  molecolari con approfondimenti relativi ai marcatori microsatellite. Campi di applicazione delle tecniche di analisi del DNA.

- Attività sperimentali in laboratorio: estrazione del DNA e sua quantificazione, amplificazione PCR ed analisi dei risultati mediante tecnica elettroforetica. 

 

Area of knowledge: Technology

- Theoretical activities: principles of DNA extraction from plant tissues ;   PCR and  its applications;  PCR-based molecular  markers with particular reference to  SSR markers.  Fields of application of molecular marker techniques.

- Practical activities in lab: DNA extraction and quantification, PCR amplification of  SSR loci, electrophoretic analyses of the detected polymorphisms.

Il laboratorio prevede l’applicazione di tecniche di analisi molecolare del DNA per la soluzione di problemi di natura applicativa, scientifica e legale 

 

 The laboratory provides pratical and theoretical knowledge on the application molecular marker techniques.

Testi consigliati e bibliografia

Oggetto:

Russel et al. Genetica agraria. Edises

 

Russel et al. Genetica agraria. Edises



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Note

Pre-requisiti: esame di Genetica e miglioramento genetico

 

Pre-requisites: exam of Genetics and Plant Breeding

 

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Ultimo aggiornamento: 20/05/2016 17:08
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